46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3255 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  577  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2924  hypothetical protein  42.22 
 
 
293 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  33.22 
 
 
916 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  37.05 
 
 
783 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  30.6 
 
 
859 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  31.35 
 
 
793 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  31.66 
 
 
801 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  34.06 
 
 
809 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  32.55 
 
 
843 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  34.17 
 
 
873 aa  106  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  31.29 
 
 
803 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  31.21 
 
 
795 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  33.01 
 
 
773 aa  99.4  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  34.64 
 
 
872 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  32.09 
 
 
862 aa  97.4  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  31.63 
 
 
792 aa  95.5  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  30.5 
 
 
795 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0898  hypothetical protein  31.79 
 
 
787 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272517  hitchhiker  0.00789103 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0909  hypothetical protein  31.79 
 
 
787 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0892  hypothetical protein  31.79 
 
 
787 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0229028  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  29.44 
 
 
853 aa  78.6  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  31.25 
 
 
854 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  23.96 
 
 
811 aa  74.3  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  31.7 
 
 
329 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0170  hypothetical protein  31.95 
 
 
318 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  30.57 
 
 
447 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  26.02 
 
 
346 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  26.97 
 
 
345 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  28.51 
 
 
345 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  42.67 
 
 
247 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  30.22 
 
 
1195 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0771  hypothetical protein  26.27 
 
 
348 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  26.71 
 
 
442 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  26.53 
 
 
315 aa  46.6  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  20.77 
 
 
342 aa  46.2  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0580  hypothetical protein  38.89 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  24.19 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  28.24 
 
 
342 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3828  hypothetical protein  30.15 
 
 
361 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1703  hypothetical protein  31.4 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6876  hypothetical protein  33.55 
 
 
344 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1980  hypothetical protein  29.51 
 
 
341 aa  43.5  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335213  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7630  hypothetical protein  37.08 
 
 
353 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1805  hypothetical protein  28.52 
 
 
332 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04260  hypothetical protein  50.98 
 
 
480 aa  43.1  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  21.05 
 
 
333 aa  42.7  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>