51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2430 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  53.87 
 
 
801 aa  756    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  56.84 
 
 
793 aa  768    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  100 
 
 
843 aa  1629    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  43.53 
 
 
854 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  37.04 
 
 
773 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  40.26 
 
 
809 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  40.35 
 
 
792 aa  364  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  34.22 
 
 
859 aa  340  8e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  33.64 
 
 
862 aa  335  2e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  34.47 
 
 
872 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  41.77 
 
 
916 aa  300  5e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  33.99 
 
 
873 aa  296  7e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  36.43 
 
 
783 aa  247  6e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  28.15 
 
 
853 aa  221  5e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  31.16 
 
 
795 aa  212  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  30.27 
 
 
803 aa  208  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  25.77 
 
 
811 aa  201  3.9999999999999996e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0898  hypothetical protein  33.4 
 
 
787 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272517  hitchhiker  0.00789103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0892  hypothetical protein  33.4 
 
 
787 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0229028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0909  hypothetical protein  33.4 
 
 
787 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  30.89 
 
 
795 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  33.22 
 
 
313 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  32.73 
 
 
442 aa  101  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  31.95 
 
 
329 aa  91.3  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2924  hypothetical protein  32.71 
 
 
293 aa  88.2  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  28.83 
 
 
447 aa  81.3  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  33.22 
 
 
1195 aa  75.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0170  hypothetical protein  29.93 
 
 
318 aa  73.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  34.55 
 
 
392 aa  62.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  32.76 
 
 
396 aa  59.3  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0194  hypothetical protein  31.62 
 
 
392 aa  58.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327389  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0158  hypothetical protein  33.33 
 
 
378 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0251545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  33.33 
 
 
862 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0168  hypothetical protein  32.48 
 
 
378 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0177  hypothetical protein  32.48 
 
 
378 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0458  hypothetical protein  35.19 
 
 
367 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.744609 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  28.02 
 
 
351 aa  55.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  34.33 
 
 
342 aa  53.5  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10206  transmembrane protein  33.94 
 
 
427 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.652566 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  31.63 
 
 
247 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  51.92 
 
 
339 aa  50.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  32.17 
 
 
345 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  22.15 
 
 
875 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  29.2 
 
 
345 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  33.33 
 
 
346 aa  48.5  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0580  hypothetical protein  41.82 
 
 
329 aa  48.1  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  33.75 
 
 
847 aa  47.8  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  31.68 
 
 
861 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2377  hypothetical protein  36.05 
 
 
362 aa  45.8  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.436987  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  26.35 
 
 
392 aa  45.4  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2627  hypothetical protein  39.62 
 
 
355 aa  44.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0802533  normal  0.461146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>