60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1950 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  100 
 
 		 773 aa  1506    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  37.23 
 
 		 793 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  38.58 
 
 		 854 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  36.81 
 
 		 801 aa  385  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  36.48 
 
 		 843 aa  347  5e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  38.7 
 
 		 809 aa  260  6e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  34.4 
 
 		 792 aa  233  8.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  31.55 
 
 		 872 aa  229  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  32.37 
 
 		 859 aa  209  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  29.41 
 
 		 862 aa  205  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  33.94 
 
 		 916 aa  197  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  32.91 
 
 		 873 aa  181  4.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  37.13 
 
 		 783 aa  176  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  30.91 
 
 		 795 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  29.14 
 
 		 803 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0898  hypothetical protein  31.8 
 
 		 787 aa  163  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272517  hitchhiker  0.00789103 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0909  hypothetical protein  31.8 
 
 		 787 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0892  hypothetical protein  31.8 
 
 		 787 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0229028  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  28.55 
 
 		 795 aa  159  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  26.7 
 
 		 853 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  24.45 
 
 		 811 aa  125  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  34.51 
 
 		 442 aa  103  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  32.85 
 
 		 313 aa  99.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  31.6 
 
 		 447 aa  93.2  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  32.73 
 
 		 329 aa  88.2  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2924  hypothetical protein  30.4 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0170  hypothetical protein  30.71 
 
 		 318 aa  80.1  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0158  hypothetical protein  35.38 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0251545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0194  hypothetical protein  36.21 
 
 		 392 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0177  hypothetical protein  35.38 
 
 		 378 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0168  hypothetical protein  35.38 
 
 		 378 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  36.91 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  32.28 
 
 		 1195 aa  57.8  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  40 
 
 		 392 aa  57  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0458  hypothetical protein  36.21 
 
 		 367 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.744609 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  45.26 
 
 		 341 aa  52.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  36.97 
 
 		 342 aa  53.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3828  hypothetical protein  31.8 
 
 		 361 aa  52  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  32.81 
 
 		 345 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  27.67 
 
 		 345 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0465  hypothetical protein  21.03 
 
 		 298 aa  49.7  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  28.28 
 
 		 346 aa  50.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  33.04 
 
 		 339 aa  48.5  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0450  integral membrane protein-like protein  22.59 
 
 		 298 aa  47.8  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950527  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  33.33 
 
 		 851 aa  47  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1913  hypothetical protein  40.45 
 
 		 377 aa  46.6  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  27.23 
 
 		 880 aa  46.2  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2237  hypothetical protein  43.28 
 
 		 344 aa  46.6  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  27.27 
 
 		 247 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10206  transmembrane protein  35.51 
 
 		 427 aa  46.2  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.652566 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  27.23 
 
 		 880 aa  45.8  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  21.99 
 
 		 345 aa  46.2  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2627  hypothetical protein  38.46 
 
 		 355 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0802533  normal  0.461146 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  23.49 
 
 		 342 aa  45.4  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4203  hypothetical protein  27.73 
 
 		 374 aa  45.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1980  hypothetical protein  31.72 
 
 		 341 aa  45.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335213  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  31.87 
 
 		 861 aa  45.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  26.14 
 
 		 315 aa  44.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2377  hypothetical protein  36.96 
 
 		 362 aa  44.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.436987  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2298  hypothetical protein  41.27 
 
 		 344 aa  43.9  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>