21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0450 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0450  integral membrane protein-like protein  100 
 
 
298 aa  588  1e-167  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950527  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0465  hypothetical protein  97.32 
 
 
298 aa  574  1.0000000000000001e-163  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  32.2 
 
 
351 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  31.8 
 
 
321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  32.23 
 
 
323 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  30.91 
 
 
358 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  28.36 
 
 
333 aa  98.2  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  27.52 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  24.74 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  25.81 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  22.49 
 
 
337 aa  63.9  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  23.66 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  24.39 
 
 
352 aa  55.8  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  26.45 
 
 
354 aa  53.1  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  27.11 
 
 
353 aa  50.1  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1853  hypothetical protein  30.14 
 
 
360 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126154  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  21.85 
 
 
773 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  30.07 
 
 
346 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  25.97 
 
 
340 aa  45.8  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  26.24 
 
 
247 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1101  hypothetical protein  25.27 
 
 
347 aa  42.7  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0490804  normal  0.681904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>