35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1959 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  706    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  24.7 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  22.03 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  28.62 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  21.97 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  24.54 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  28.57 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  24.23 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0911  hypothetical protein  23.2 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00529353  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  26.19 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  22.39 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  22.79 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  21.96 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  22.87 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  25 
 
 		 352 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0450  integral membrane protein-like protein  26.45 
 
 		 298 aa  53.1  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950527  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1853  hypothetical protein  23.53 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126154  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  25.99 
 
 		 374 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  23.61 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  21.77 
 
 		 347 aa  51.2  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  23.42 
 
 		 340 aa  50.4  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0465  hypothetical protein  26.09 
 
 		 298 aa  50.4  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  21.99 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  24.81 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  20.53 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  27.5 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  27.44 
 
 		 340 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  25.45 
 
 		 340 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2780  hypothetical protein  24.93 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  28.91 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  21.52 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  23.53 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0733  hypothetical protein  26.09 
 
 		 350 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.97575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  24.49 
 
 		 333 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  24.49 
 
 		 333 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>