35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1853 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1853  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  715    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126154  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  47.67 
 
 
352 aa  276  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  30.5 
 
 
353 aa  100  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  25.6 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  24.74 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  24.74 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  25.21 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  23.02 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  26.45 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  26.67 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  24.38 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  26.46 
 
 
337 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  25.48 
 
 
338 aa  63.9  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  22.98 
 
 
354 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  26.32 
 
 
352 aa  60.1  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  21.07 
 
 
323 aa  59.7  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0450  integral membrane protein-like protein  26.27 
 
 
298 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  23.68 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  25.28 
 
 
338 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1341  hypothetical protein  25.82 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0465  hypothetical protein  25.49 
 
 
298 aa  55.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  24.76 
 
 
358 aa  55.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  21.13 
 
 
347 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  24.02 
 
 
337 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  21.07 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  28.92 
 
 
332 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17930  hypothetical protein  30.59 
 
 
330 aa  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558926  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  23.22 
 
 
358 aa  48.9  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  25.55 
 
 
366 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  24.34 
 
 
342 aa  46.6  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  21.69 
 
 
335 aa  46.6  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  22.83 
 
 
348 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  29.67 
 
 
340 aa  44.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  25.4 
 
 
351 aa  44.3  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  28.57 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>