33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1341 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1341  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  619  1e-176  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  27.44 
 
 
340 aa  95.9  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  27.41 
 
 
342 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  26.69 
 
 
347 aa  86.7  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  28.08 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  25.38 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  27.02 
 
 
347 aa  79  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  24.38 
 
 
352 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  25.89 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  25.78 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  22.15 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  22.88 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  24.93 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  22.87 
 
 
342 aa  62.8  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1853  hypothetical protein  27.08 
 
 
360 aa  62.4  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126154  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  23.65 
 
 
342 aa  60.1  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  25.79 
 
 
345 aa  59.3  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  22.22 
 
 
352 aa  59.3  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  22.32 
 
 
347 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  20.12 
 
 
344 aa  56.2  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  22.75 
 
 
333 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  22.75 
 
 
333 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  21.67 
 
 
374 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  22.85 
 
 
330 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  22.85 
 
 
330 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  23.86 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  22.37 
 
 
332 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  22.81 
 
 
358 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  21.66 
 
 
354 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  26.92 
 
 
795 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  25.42 
 
 
358 aa  43.1  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  24.28 
 
 
335 aa  43.1  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1651  hypothetical protein  23.91 
 
 
334 aa  42.4  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0104013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>