36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3008 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  696    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1853  hypothetical protein  47.67 
 
 
360 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126154  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  27.17 
 
 
352 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  28.21 
 
 
353 aa  91.7  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  25.77 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  25 
 
 
346 aa  79  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1341  hypothetical protein  28.08 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  23.71 
 
 
347 aa  75.5  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  23.75 
 
 
374 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  23.66 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  24.44 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  21.38 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  25.8 
 
 
366 aa  67  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  24.56 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  23.84 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  23.08 
 
 
344 aa  65.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  22.63 
 
 
323 aa  64.3  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  26.13 
 
 
352 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  24.82 
 
 
347 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  21.8 
 
 
335 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0465  hypothetical protein  24.91 
 
 
298 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  21.69 
 
 
358 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  25.19 
 
 
345 aa  58.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  24.21 
 
 
321 aa  57.8  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  26.42 
 
 
337 aa  56.6  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0450  integral membrane protein-like protein  24.39 
 
 
298 aa  56.2  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950527  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  24.49 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  23.36 
 
 
342 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  24.08 
 
 
340 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  22.86 
 
 
333 aa  53.1  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  24.11 
 
 
340 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  20.71 
 
 
354 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  21.99 
 
 
338 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  25.34 
 
 
332 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  23.05 
 
 
342 aa  45.8  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0911  hypothetical protein  22.93 
 
 
432 aa  44.3  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00529353  normal  0.444552 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>