25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0911 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0911  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  880    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00529353  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  28.28 
 
 
342 aa  108  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  23.84 
 
 
337 aa  99.8  8e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  23.97 
 
 
345 aa  91.7  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  23.69 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  27.05 
 
 
342 aa  79  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  23.2 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  27 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  24.53 
 
 
352 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  22.93 
 
 
352 aa  57.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  24.18 
 
 
321 aa  53.5  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0450  integral membrane protein-like protein  21.01 
 
 
298 aa  51.6  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  21.56 
 
 
374 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  23.55 
 
 
358 aa  51.6  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0465  hypothetical protein  20.62 
 
 
298 aa  51.2  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  22.35 
 
 
340 aa  50.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  25.19 
 
 
330 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  21.86 
 
 
351 aa  46.2  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  21.69 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  24.28 
 
 
348 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  23.88 
 
 
330 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  23.57 
 
 
330 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  22.09 
 
 
344 aa  43.5  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  23.08 
 
 
323 aa  43.1  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  28.74 
 
 
353 aa  43.1  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>