39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1439 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  662    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  30.06 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  26.51 
 
 		 358 aa  96.3  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  26.71 
 
 		 351 aa  90.1  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  28.77 
 
 		 352 aa  90.1  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  28.57 
 
 		 333 aa  86.7  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  25.63 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  25.3 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0465  hypothetical protein  25.84 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0450  integral membrane protein-like protein  25.5 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950527  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  24.79 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  24.7 
 
 		 337 aa  72.4  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  24.32 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  23.03 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  23.95 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  24.42 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  24.12 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  23.86 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  22.54 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  23.29 
 
 		 332 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  24.47 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  24.62 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  21.27 
 
 		 366 aa  53.9  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  24.55 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  23.78 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  24.76 
 
 		 347 aa  49.3  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1853  hypothetical protein  25.93 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  23.53 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  23.55 
 
 		 352 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  23.62 
 
 		 337 aa  46.2  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  27.65 
 
 		 353 aa  46.2  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  23.01 
 
 		 333 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  22.83 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  25.36 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  23.74 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  22.88 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  28.61 
 
 		 338 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0384  hypothetical protein  31.67 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  23.7 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>