20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0384 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0384  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  624  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2758  hypothetical protein  37.21 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  27.21 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  21.8 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  25.32 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  22.39 
 
 		 340 aa  50.1  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  26.88 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  20.36 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  22.89 
 
 		 345 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  20.38 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  24.64 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  25.64 
 
 		 330 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  28.44 
 
 		 338 aa  46.2  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  21.61 
 
 		 335 aa  46.2  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  21.16 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  25.27 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  25.27 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  25 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  34.21 
 
 		 342 aa  42.7  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  28.57 
 
 		 347 aa  42.7  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0546223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>