35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1587 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  100 
 
 		 338 aa  674    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  40.19 
 
 		 337 aa  246  4e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  36.09 
 
 		 345 aa  179  4.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  29.74 
 
 		 342 aa  166  4e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  26.67 
 
 		 354 aa  96.7  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  26.4 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  24.26 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  26.62 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0911  hypothetical protein  23.69 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00529353  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  25.69 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  23.47 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  24.44 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  25.3 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  25.71 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  26.04 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  22.92 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0465  hypothetical protein  23.89 
 
 		 298 aa  62  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0450  integral membrane protein-like protein  23.66 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950527  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  23.47 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  24.46 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  26.52 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  27.57 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  20.25 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  25.79 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  22.92 
 
 		 342 aa  53.9  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  21.99 
 
 		 335 aa  53.1  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  23.2 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  24.33 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  24.07 
 
 		 358 aa  50.8  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1853  hypothetical protein  23.9 
 
 		 360 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126154  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  25.59 
 
 		 340 aa  46.6  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  22.91 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0384  hypothetical protein  32.84 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  34.67 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  20.76 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>