15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2758 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2758  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  564  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0384  hypothetical protein  36.18 
 
 
331 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  26.25 
 
 
342 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  24.74 
 
 
352 aa  67  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  29.56 
 
 
330 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  25.38 
 
 
347 aa  50.8  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  22.89 
 
 
340 aa  50.4  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  26.04 
 
 
332 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  28 
 
 
330 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  25.09 
 
 
352 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  28 
 
 
330 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  25.95 
 
 
333 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  22.14 
 
 
347 aa  45.8  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  28.67 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  31.68 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>