45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0961 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  658    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  28.7 
 
 
352 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  26.95 
 
 
342 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  27.25 
 
 
342 aa  123  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  28.3 
 
 
348 aa  119  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  26.02 
 
 
347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  26.54 
 
 
346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  23.93 
 
 
344 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  27.63 
 
 
353 aa  106  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  27.76 
 
 
347 aa  102  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  26.15 
 
 
366 aa  99.4  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  25.47 
 
 
352 aa  96.7  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  24.32 
 
 
338 aa  96.3  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  27.81 
 
 
337 aa  92.8  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1341  hypothetical protein  29.76 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  20.8 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  26.3 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  21.62 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  25.46 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  28 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  23.81 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  23.13 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  23.13 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  24.11 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  27.42 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  25.08 
 
 
335 aa  67  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  22.98 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  23.49 
 
 
330 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  24.08 
 
 
358 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  22.87 
 
 
333 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  22.14 
 
 
333 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1651  hypothetical protein  24.82 
 
 
334 aa  59.3  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0104013  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  26.02 
 
 
338 aa  59.7  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  26.94 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17930  hypothetical protein  26.14 
 
 
330 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558926  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1853  hypothetical protein  24.4 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126154  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  24.08 
 
 
352 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  25.7 
 
 
321 aa  55.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0434  hypothetical protein  25.45 
 
 
357 aa  53.1  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0718822  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1933  hypothetical protein  23.24 
 
 
360 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.235318  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  23.42 
 
 
354 aa  50.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0465  hypothetical protein  27.13 
 
 
298 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0450  integral membrane protein-like protein  25.97 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950527  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  22.78 
 
 
358 aa  45.8  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0911  hypothetical protein  32.39 
 
 
432 aa  43.5  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00529353  normal  0.444552 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>