42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0650 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  100 
 
 
342 aa  685    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  41.77 
 
 
337 aa  258  1e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  36.42 
 
 
345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  31.67 
 
 
338 aa  162  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  24.7 
 
 
354 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0911  hypothetical protein  28.28 
 
 
432 aa  86.7  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00529353  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  25.68 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  26.72 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  25.85 
 
 
333 aa  75.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  28 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  26.08 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0465  hypothetical protein  26.21 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  24.05 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  26.16 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0450  integral membrane protein-like protein  25.81 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950527  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  25.63 
 
 
346 aa  63.5  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  24.75 
 
 
347 aa  62.8  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  22.93 
 
 
338 aa  62.8  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  22.81 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  21.59 
 
 
374 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  24.8 
 
 
342 aa  56.2  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  23.53 
 
 
340 aa  56.2  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  22.88 
 
 
358 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1101  hypothetical protein  22.01 
 
 
347 aa  55.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0490804  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  22.36 
 
 
348 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  23.68 
 
 
332 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  24.45 
 
 
347 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  24.81 
 
 
321 aa  52.8  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  22.97 
 
 
351 aa  52.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  23.96 
 
 
366 aa  50.4  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  30.4 
 
 
330 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  30.4 
 
 
330 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  25.41 
 
 
323 aa  49.3  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  25.61 
 
 
358 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1933  hypothetical protein  24.5 
 
 
360 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.235318  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  27.64 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  24.64 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  27.64 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  23.85 
 
 
247 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  22.9 
 
 
352 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  20.18 
 
 
346 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  24.57 
 
 
803 aa  43.1  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>