47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0389 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  100 
 
 		 345 aa  690    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  38.46 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  36.42 
 
 		 342 aa  209  5e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  36.09 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  27.97 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  21.62 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0911  hypothetical protein  24.29 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00529353  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  21.97 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  29.48 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0450  integral membrane protein-like protein  27.52 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950527  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  27.92 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  25.61 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0465  hypothetical protein  26.74 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  23.77 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  24.9 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1853  hypothetical protein  23.46 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126154  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  25.18 
 
 		 352 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  24.47 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  25 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  25.49 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  22.09 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  25.1 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  24.66 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  22.69 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  26.44 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  22.94 
 
 		 358 aa  53.9  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  24.87 
 
 		 353 aa  53.5  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  24.66 
 
 		 347 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  24.58 
 
 		 323 aa  50.8  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  21.25 
 
 		 358 aa  50.1  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  25.1 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  26.19 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1341  hypothetical protein  25.48 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1651  hypothetical protein  36.92 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0104013  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  25.1 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  23.6 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1222  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.997837  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  24.9 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  27.4 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  37.8 
 
 		 330 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  22.69 
 
 		 330 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2298  hypothetical protein  26.14 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  21.99 
 
 		 773 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  21.27 
 
 		 374 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  23.69 
 
 		 339 aa  42.7  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  22.8 
 
 		 340 aa  42.7  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  21.76 
 
 		 333 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>