35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0739 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  687    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  32.43 
 
 
358 aa  149  8e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  29.22 
 
 
321 aa  143  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0450  integral membrane protein-like protein  33.22 
 
 
298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950527  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0465  hypothetical protein  33.22 
 
 
298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  32.32 
 
 
323 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  31.21 
 
 
333 aa  119  7e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  25.35 
 
 
352 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  26.32 
 
 
335 aa  93.2  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  25.89 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1933  hypothetical protein  25.07 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.235318  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  25.47 
 
 
347 aa  63.9  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  27.5 
 
 
354 aa  63.2  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  24.4 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  28.49 
 
 
366 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  23.15 
 
 
342 aa  60.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  21.45 
 
 
337 aa  59.7  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  24.83 
 
 
348 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  26.32 
 
 
352 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  26.14 
 
 
345 aa  56.6  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1651  hypothetical protein  23 
 
 
334 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0104013  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  23.57 
 
 
342 aa  53.9  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  27.46 
 
 
358 aa  53.1  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  25.57 
 
 
347 aa  52.8  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  23.36 
 
 
337 aa  52.8  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  24.29 
 
 
374 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0485  hypothetical protein  23.37 
 
 
391 aa  49.3  0.00009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.769995  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  21.36 
 
 
346 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0911  hypothetical protein  25.59 
 
 
432 aa  47  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00529353  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  29.79 
 
 
859 aa  46.2  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  39.39 
 
 
793 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  24.92 
 
 
347 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  23.73 
 
 
353 aa  43.5  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  21.54 
 
 
862 aa  43.1  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  24.55 
 
 
340 aa  43.1  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>