39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4434 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  62.95 
 
 		 333 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  61.75 
 
 		 333 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  58.64 
 
 		 330 aa  361  9e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  62.01 
 
 		 330 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  62.05 
 
 		 330 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  61.72 
 
 		 330 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17930  hypothetical protein  58.28 
 
 		 330 aa  285  9e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558926  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1222  hypothetical protein  52.7 
 
 		 330 aa  266  5e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.997837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1651  hypothetical protein  37.22 
 
 		 334 aa  170  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0104013  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  23.47 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  23.33 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  25.08 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  24.19 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  23.77 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  23 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  25.69 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  22.39 
 
 		 354 aa  57  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  20.93 
 
 		 337 aa  57  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  24.83 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  22.06 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  28.52 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  23.68 
 
 		 342 aa  53.9  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  29.94 
 
 		 341 aa  53.1  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  25.25 
 
 		 358 aa  53.1  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  31.47 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  21.25 
 
 		 348 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  23.64 
 
 		 338 aa  50.4  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  32.52 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  19.86 
 
 		 344 aa  46.6  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  20.92 
 
 		 352 aa  46.6  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  21.79 
 
 		 337 aa  46.2  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2758  hypothetical protein  29.93 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  20.92 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  20.93 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  28.11 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  25.44 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0626  hypothetical protein  28.84 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0246806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  23.91 
 
 		 374 aa  42.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>