34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_56050 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  98.5 
 
 		 333 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  643    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  61.71 
 
 		 332 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  56.92 
 
 		 330 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  59.74 
 
 		 330 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  59.41 
 
 		 330 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  57.79 
 
 		 330 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17930  hypothetical protein  61.92 
 
 		 330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558926  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1222  hypothetical protein  55.59 
 
 		 330 aa  261  8.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.997837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1651  hypothetical protein  37.22 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0104013  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  24.01 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  26.42 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  22.78 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  23.33 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  23.63 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  24.48 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  23.68 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  24.45 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  20.96 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  26.22 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  23.55 
 
 		 338 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  24.46 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1980  hypothetical protein  25.86 
 
 		 341 aa  46.6  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335213  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  27.78 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  30.56 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  20.64 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  21.79 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  23.05 
 
 		 352 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  20.38 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  22.56 
 
 		 346 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  23.57 
 
 		 358 aa  43.1  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  24.49 
 
 		 354 aa  42.7  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  28.43 
 
 		 342 aa  42.7  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  21.34 
 
 		 345 aa  42.4  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>