28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1924 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  628  1e-179  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  38.85 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  34.47 
 
 		 358 aa  184  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0465  hypothetical protein  30.77 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  32.09 
 
 		 351 aa  123  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0450  integral membrane protein-like protein  31.5 
 
 		 298 aa  122  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950527  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  26.62 
 
 		 333 aa  105  9e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  25.51 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  25.58 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  21.26 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  25.36 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  22.79 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  25.94 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1853  hypothetical protein  22.36 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126154  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  25 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  25.5 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  25.41 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  27.31 
 
 		 340 aa  49.7  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  31.15 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  24.63 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  22.09 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  26.03 
 
 		 338 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  25.44 
 
 		 358 aa  46.2  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  24.63 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  24.89 
 
 		 374 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  25.83 
 
 		 353 aa  44.3  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0434  hypothetical protein  28.57 
 
 		 357 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0718822  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  24.4 
 
 		 330 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>