34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4881 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  98.5 
 
 		 333 aa  636    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  643    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  62.97 
 
 		 332 aa  391  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  57.23 
 
 		 330 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  61.18 
 
 		 330 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  60.86 
 
 		 330 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  58.77 
 
 		 330 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17930  hypothetical protein  62.58 
 
 		 330 aa  309  5e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558926  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1222  hypothetical protein  55.91 
 
 		 330 aa  261  8e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.997837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1651  hypothetical protein  36.91 
 
 		 334 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0104013  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  26.42 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  23.36 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  23.49 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  23.33 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  23.34 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  23.3 
 
 		 347 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  23.31 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  24.45 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  21.25 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  25.87 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1980  hypothetical protein  26.04 
 
 		 341 aa  49.7  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335213  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  24.1 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  28.38 
 
 		 341 aa  47.4  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  25.1 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  23.08 
 
 		 338 aa  46.2  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  22.34 
 
 		 347 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  23.42 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  20.7 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  23.23 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  29.41 
 
 		 342 aa  43.5  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  19.93 
 
 		 344 aa  43.1  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2758  hypothetical protein  28.17 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  24.49 
 
 		 354 aa  42.7  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  21.76 
 
 		 345 aa  42.7  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>