50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1276 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  100 
 
 
347 aa  692    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  46.04 
 
 
347 aa  333  3e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  44.71 
 
 
338 aa  292  7e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  44.67 
 
 
352 aa  288  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  41.23 
 
 
346 aa  259  4e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  44.28 
 
 
366 aa  258  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  40.36 
 
 
337 aa  253  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  33.23 
 
 
348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  30.84 
 
 
347 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  30.79 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  32.44 
 
 
344 aa  159  8e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  29.08 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  26.93 
 
 
342 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0434  hypothetical protein  33.11 
 
 
357 aa  105  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0718822  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  22.85 
 
 
352 aa  93.2  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  20.8 
 
 
340 aa  86.3  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  24.28 
 
 
353 aa  86.3  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  25.86 
 
 
374 aa  79.7  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  26.33 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  29.19 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  23.7 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  25.75 
 
 
321 aa  69.3  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  24.56 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  32.1 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  24.75 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  26.93 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  23.84 
 
 
352 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  24.18 
 
 
340 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  26.51 
 
 
354 aa  63.9  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  23.68 
 
 
342 aa  64.3  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  24.71 
 
 
316 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  23.67 
 
 
340 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  23 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  24.21 
 
 
330 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  24.51 
 
 
330 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  24.4 
 
 
338 aa  60.1  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  24.91 
 
 
345 aa  60.1  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  24.51 
 
 
330 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1341  hypothetical protein  27.46 
 
 
317 aa  58.9  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  24.84 
 
 
323 aa  55.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1853  hypothetical protein  24.07 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126154  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  24.4 
 
 
337 aa  50.1  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  24.92 
 
 
351 aa  48.9  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  24.18 
 
 
335 aa  46.2  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  22.18 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  28.28 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  21.79 
 
 
333 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  22.94 
 
 
339 aa  43.5  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  24.1 
 
 
385 aa  42.7  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17930  hypothetical protein  21.24 
 
 
330 aa  43.1  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>