27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1365 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  758    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  25.46 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  23.53 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  26.32 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  23.75 
 
 
352 aa  72.8  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  22.87 
 
 
347 aa  72.4  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  24.38 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  21.94 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  24.86 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  23.03 
 
 
366 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  24.03 
 
 
335 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  25.2 
 
 
338 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  28 
 
 
353 aa  59.3  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  26.52 
 
 
338 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  21.59 
 
 
342 aa  58.5  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  24.6 
 
 
337 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  21.21 
 
 
347 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  19.25 
 
 
342 aa  53.9  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  20.45 
 
 
352 aa  52.8  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  25.99 
 
 
354 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1853  hypothetical protein  23.28 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126154  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  21.95 
 
 
333 aa  49.7  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  25.39 
 
 
351 aa  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  29.29 
 
 
348 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  19.76 
 
 
344 aa  43.5  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  21.37 
 
 
345 aa  43.1  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  27.14 
 
 
330 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>