67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1275 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  695    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  46.04 
 
 
347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  43.62 
 
 
338 aa  300  3e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  44.96 
 
 
346 aa  288  1e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  43.86 
 
 
352 aa  287  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  42.14 
 
 
337 aa  280  4e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  40.63 
 
 
366 aa  235  7e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  34.16 
 
 
344 aa  196  6e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  32.65 
 
 
342 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  31.49 
 
 
347 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  30.41 
 
 
348 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  31.42 
 
 
340 aa  149  5e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0434  hypothetical protein  32.07 
 
 
357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0718822  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  27.68 
 
 
342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  27.76 
 
 
340 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  26.41 
 
 
352 aa  97.1  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  26.61 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  24.58 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  26.58 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  26.67 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  26.97 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  23.71 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  22.87 
 
 
374 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  23.26 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  26.08 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  24.93 
 
 
321 aa  67  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1341  hypothetical protein  26.69 
 
 
317 aa  64.3  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  27.66 
 
 
338 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  24.38 
 
 
358 aa  60.5  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  23.58 
 
 
385 aa  60.5  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  22.71 
 
 
330 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  21.61 
 
 
330 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  21.61 
 
 
330 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  20.25 
 
 
338 aa  56.2  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  25.47 
 
 
351 aa  56.2  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  25.1 
 
 
345 aa  55.8  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1853  hypothetical protein  25 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126154  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  23.26 
 
 
325 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  25.52 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  22.29 
 
 
337 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  23.27 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  24.42 
 
 
360 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  23.95 
 
 
333 aa  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  21.77 
 
 
354 aa  51.2  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1651  hypothetical protein  22.92 
 
 
334 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0104013  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  24.21 
 
 
326 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  21.57 
 
 
333 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  20.85 
 
 
333 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  21.09 
 
 
304 aa  50.1  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  22.97 
 
 
316 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  23.08 
 
 
346 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  31.15 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  29.59 
 
 
303 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  23.55 
 
 
350 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
586 aa  46.6  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  23.47 
 
 
297 aa  46.6  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0043  hypothetical protein  25.69 
 
 
363 aa  46.6  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  24.6 
 
 
358 aa  46.6  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17930  hypothetical protein  21.24 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  23.51 
 
 
281 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  23.08 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1222  hypothetical protein  27.27 
 
 
330 aa  43.5  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.997837  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1980  hypothetical protein  22.9 
 
 
341 aa  43.5  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335213  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  24.37 
 
 
392 aa  43.5  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  34.04 
 
 
298 aa  43.1  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  25.08 
 
 
320 aa  42.7  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0745  hypothetical protein  23.53 
 
 
316 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.579699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>