31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0184 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  713    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  34.67 
 
 
323 aa  176  6e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  31.93 
 
 
321 aa  155  9e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  32.18 
 
 
351 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  29.66 
 
 
333 aa  140  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0450  integral membrane protein-like protein  30.91 
 
 
298 aa  107  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950527  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0465  hypothetical protein  30.18 
 
 
298 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  26.9 
 
 
335 aa  86.3  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  24.75 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  21.11 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  26.88 
 
 
366 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  25 
 
 
347 aa  60.1  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  24.35 
 
 
352 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  27.41 
 
 
352 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  22.94 
 
 
345 aa  53.5  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  25.16 
 
 
346 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  26.27 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0485  hypothetical protein  25.45 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.769995  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  25.07 
 
 
342 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  21.99 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  35 
 
 
338 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  24.53 
 
 
338 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  25.61 
 
 
342 aa  48.5  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  25.25 
 
 
339 aa  47.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  27.52 
 
 
337 aa  46.2  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  22.78 
 
 
340 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  29.27 
 
 
353 aa  45.8  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0434  hypothetical protein  23.88 
 
 
357 aa  43.9  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0718822  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  27.85 
 
 
342 aa  42.7  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  23.31 
 
 
347 aa  42.7  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1933  hypothetical protein  26.56 
 
 
360 aa  42.7  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.235318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>