19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0465 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0465  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  589  1e-167  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0450  integral membrane protein-like protein  97.32 
 
 
298 aa  574  1.0000000000000001e-163  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950527  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  32.2 
 
 
351 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  30.77 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  32.56 
 
 
321 aa  117  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  30.18 
 
 
358 aa  104  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  28.36 
 
 
333 aa  98.2  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  25.09 
 
 
335 aa  72  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  26.74 
 
 
345 aa  68.9  0.00000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  26.21 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  23.05 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  23.89 
 
 
338 aa  61.6  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  24.91 
 
 
352 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  26.09 
 
 
354 aa  50.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  27.13 
 
 
340 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  21.85 
 
 
773 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1853  hypothetical protein  30.14 
 
 
360 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126154  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  30.07 
 
 
346 aa  45.8  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  26.24 
 
 
247 aa  42.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>