61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1204 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  75.6 
 
 
795 aa  1103    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0892  hypothetical protein  73.33 
 
 
787 aa  998    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0229028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0909  hypothetical protein  73.33 
 
 
787 aa  998    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  100 
 
 
795 aa  1563    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0898  hypothetical protein  73.58 
 
 
787 aa  1000    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272517  hitchhiker  0.00789103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  85.8 
 
 
803 aa  1321    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  31.1 
 
 
793 aa  203  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  28.41 
 
 
859 aa  200  7.999999999999999e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  26.63 
 
 
801 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  30.91 
 
 
843 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  28.09 
 
 
862 aa  182  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  26.62 
 
 
853 aa  181  4.999999999999999e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  30.26 
 
 
854 aa  178  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  34.98 
 
 
783 aa  169  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  31.39 
 
 
809 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  29.51 
 
 
792 aa  164  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  24.88 
 
 
811 aa  164  7e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  28.55 
 
 
773 aa  164  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  30.77 
 
 
872 aa  162  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  31.21 
 
 
916 aa  150  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  27.99 
 
 
873 aa  135  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  31.29 
 
 
313 aa  104  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  31.61 
 
 
447 aa  95.5  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  30 
 
 
442 aa  91.3  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2924  hypothetical protein  30.37 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0170  hypothetical protein  28.68 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  24.42 
 
 
346 aa  63.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  30.83 
 
 
862 aa  61.2  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  25.57 
 
 
329 aa  57.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  40.19 
 
 
1195 aa  57.8  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0771  hypothetical protein  27.06 
 
 
348 aa  57.4  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  30.83 
 
 
346 aa  57.4  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  29.2 
 
 
247 aa  56.2  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  36.72 
 
 
342 aa  54.7  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  24.91 
 
 
360 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  33.93 
 
 
339 aa  51.6  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2627  hypothetical protein  39.62 
 
 
355 aa  50.8  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0802533  normal  0.461146 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  27.11 
 
 
315 aa  50.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1980  hypothetical protein  31.65 
 
 
341 aa  49.7  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335213  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  21.98 
 
 
875 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  30.47 
 
 
345 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  29.92 
 
 
396 aa  47.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  32.31 
 
 
345 aa  47  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2588  integral membrane protein  33.91 
 
 
347 aa  46.2  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000735046  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  23.11 
 
 
340 aa  46.6  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  35.71 
 
 
861 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  34.29 
 
 
861 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  34.29 
 
 
861 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  34.29 
 
 
861 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  27.86 
 
 
386 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  23.53 
 
 
350 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  34.29 
 
 
861 aa  45.8  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  34.29 
 
 
861 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  34.29 
 
 
861 aa  45.8  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  34.29 
 
 
861 aa  45.8  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  34.71 
 
 
327 aa  45.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  28 
 
 
328 aa  45.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  34.15 
 
 
392 aa  44.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  28.92 
 
 
858 aa  44.7  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1148  aminoglycoside phosphotransferase  27.42 
 
 
269 aa  44.3  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  45.28 
 
 
339 aa  44.3  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>