32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0170 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0170  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  595  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  65.9 
 
 		 329 aa  335  7.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  33.1 
 
 		 773 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  35.83 
 
 		 442 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  26.05 
 
 		 793 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  33.45 
 
 		 854 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  32.23 
 
 		 792 aa  82.8  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  30.19 
 
 		 801 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  31.12 
 
 		 803 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  28.57 
 
 		 859 aa  73.9  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  28.62 
 
 		 795 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  30.68 
 
 		 843 aa  73.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  31.95 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  31.14 
 
 		 795 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  30.74 
 
 		 447 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  30.34 
 
 		 783 aa  66.2  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  28.03 
 
 		 916 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  30.63 
 
 		 809 aa  63.2  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0909  hypothetical protein  30.71 
 
 		 787 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0892  hypothetical protein  30.71 
 
 		 787 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0229028  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0898  hypothetical protein  30.71 
 
 		 787 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272517  hitchhiker  0.00789103 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  26.95 
 
 		 853 aa  55.8  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2924  hypothetical protein  26.87 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  28.57 
 
 		 346 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  26.77 
 
 		 811 aa  52.8  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  33.82 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  32.14 
 
 		 345 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  27.24 
 
 		 862 aa  49.7  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  35.42 
 
 		 247 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  28.77 
 
 		 1195 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  22.35 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  23.99 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>