44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10596 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0892  hypothetical protein  71.45 
 
 
787 aa  961    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0229028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0909  hypothetical protein  71.45 
 
 
787 aa  961    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  75.6 
 
 
795 aa  1139    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0898  hypothetical protein  71.57 
 
 
787 aa  963    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272517  hitchhiker  0.00789103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  73.6 
 
 
803 aa  1124    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  100 
 
 
795 aa  1559    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  30.39 
 
 
793 aa  205  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  27.64 
 
 
859 aa  191  5.999999999999999e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  27.72 
 
 
801 aa  181  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  31.1 
 
 
773 aa  177  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  30.51 
 
 
792 aa  173  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  31.84 
 
 
809 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  30.86 
 
 
854 aa  167  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  34.77 
 
 
783 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  29.57 
 
 
843 aa  160  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  24.57 
 
 
853 aa  157  7e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  28.61 
 
 
862 aa  156  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  24.51 
 
 
811 aa  152  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  29.09 
 
 
873 aa  149  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  29.93 
 
 
916 aa  144  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  28.35 
 
 
872 aa  140  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  32.76 
 
 
442 aa  105  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  30.58 
 
 
313 aa  101  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  32.69 
 
 
447 aa  97.8  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2924  hypothetical protein  28.25 
 
 
293 aa  69.7  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0170  hypothetical protein  29.55 
 
 
318 aa  65.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  27.78 
 
 
329 aa  58.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0771  hypothetical protein  30.52 
 
 
348 aa  55.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  22.46 
 
 
346 aa  53.9  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  27.82 
 
 
862 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  24.9 
 
 
321 aa  53.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  37.25 
 
 
1195 aa  51.6  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  21.98 
 
 
340 aa  50.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  26.89 
 
 
346 aa  50.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  42.22 
 
 
342 aa  49.3  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  24.44 
 
 
315 aa  48.9  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  28.69 
 
 
247 aa  47.8  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  25.33 
 
 
386 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  23.86 
 
 
360 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1980  hypothetical protein  39.24 
 
 
341 aa  45.4  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335213  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  42.37 
 
 
396 aa  45.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  23.94 
 
 
350 aa  44.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  30.91 
 
 
339 aa  44.7  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  21.79 
 
 
342 aa  44.3  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>