30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3454 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  100 
 
 		 873 aa  1663    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  50.98 
 
 		 859 aa  687    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  54.31 
 
 		 872 aa  728    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  48.64 
 
 		 862 aa  683    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  51.34 
 
 		 916 aa  438  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  33.41 
 
 		 801 aa  328  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  33.99 
 
 		 843 aa  317  8e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  34.07 
 
 		 793 aa  296  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  28.11 
 
 		 853 aa  275  3e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  32.66 
 
 		 854 aa  271  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  26.63 
 
 		 811 aa  255  2.0000000000000002e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  36.72 
 
 		 809 aa  249  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  33.16 
 
 		 792 aa  247  9e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  29.04 
 
 		 803 aa  221  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  30.25 
 
 		 773 aa  206  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  27.84 
 
 		 795 aa  189  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  28.72 
 
 		 795 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0892  hypothetical protein  27.98 
 
 		 787 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0229028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0909  hypothetical protein  27.98 
 
 		 787 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0898  hypothetical protein  27.86 
 
 		 787 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272517  hitchhiker  0.00789103 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  34.17 
 
 		 313 aa  120  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2924  hypothetical protein  31.38 
 
 		 293 aa  88.6  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  28.47 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  29.43 
 
 		 447 aa  64.3  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  29.8 
 
 		 329 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  33.04 
 
 		 345 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  32.14 
 
 		 345 aa  48.1  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  40 
 
 		 339 aa  47.4  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  31.43 
 
 		 315 aa  45.4  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0580  hypothetical protein  36.36 
 
 		 329 aa  44.7  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>