43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0580 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0580  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  611  9.999999999999999e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4203  hypothetical protein  34.9 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0458  hypothetical protein  28.9 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.744609 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2377  hypothetical protein  37.5 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.436987  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  33.91 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0158  hypothetical protein  33.08 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0251545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0194  hypothetical protein  26.77 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0168  hypothetical protein  33.08 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0177  hypothetical protein  33.08 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  36.13 
 
 		 862 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  34.45 
 
 		 859 aa  57  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0771  hypothetical protein  26.65 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10206  transmembrane protein  27.24 
 
 		 427 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.652566 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  34.48 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  38.18 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  28.52 
 
 		 396 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  37.38 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  44.64 
 
 		 811 aa  53.9  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  28.75 
 
 		 339 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  41.18 
 
 		 872 aa  53.1  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0057  integral membrane protein  34.25 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  33.33 
 
 		 873 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  28.7 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  35.63 
 
 		 792 aa  49.7  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  26.63 
 
 		 281 aa  50.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  33.33 
 
 		 783 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  35.44 
 
 		 854 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  42.86 
 
 		 853 aa  48.1  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  32.65 
 
 		 795 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  41.82 
 
 		 843 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  28.96 
 
 		 803 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  32.43 
 
 		 916 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  25 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  24.51 
 
 		 340 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  30.69 
 
 		 442 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  22.95 
 
 		 340 aa  46.2  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  23.53 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  38.89 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4553  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0024  hypothetical protein  30.89 
 
 		 338 aa  43.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  34.62 
 
 		 773 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  34.18 
 
 		 320 aa  42.4  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  30.77 
 
 		 840 aa  42.7  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>