51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0352 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  786    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  52.13 
 
 		 392 aa  348  7e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0194  hypothetical protein  45.08 
 
 		 392 aa  291  9e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0158  hypothetical protein  47.12 
 
 		 378 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0251545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0168  hypothetical protein  47.12 
 
 		 378 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0177  hypothetical protein  47.12 
 
 		 378 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0458  hypothetical protein  49.69 
 
 		 367 aa  277  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.744609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10206  transmembrane protein  45.63 
 
 		 427 aa  271  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.652566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  36.84 
 
 		 793 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  36.91 
 
 		 773 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  28.31 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  36.04 
 
 		 801 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4203  hypothetical protein  27.97 
 
 		 374 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  27.71 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  35.54 
 
 		 783 aa  60.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  33.63 
 
 		 843 aa  60.1  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  41 
 
 		 792 aa  59.7  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  24.08 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  42.68 
 
 		 859 aa  58.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7630  hypothetical protein  27.03 
 
 		 353 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  22.31 
 
 		 340 aa  53.1  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1101  hypothetical protein  26.8 
 
 		 347 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0490804  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  36.13 
 
 		 341 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1430  hypothetical protein  25.96 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0580  hypothetical protein  30.22 
 
 		 329 aa  50.8  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  39.39 
 
 		 809 aa  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3499  hypothetical protein  36.73 
 
 		 319 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0771  hypothetical protein  26.4 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6876  hypothetical protein  29.89 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  23.9 
 
 		 340 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  42.5 
 
 		 811 aa  47.4  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  28.81 
 
 		 861 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  29.35 
 
 		 851 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  27.41 
 
 		 315 aa  47  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  28.26 
 
 		 851 aa  46.6  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  54.35 
 
 		 853 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  30.7 
 
 		 342 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  28.85 
 
 		 916 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  32.43 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  26.32 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  42.37 
 
 		 795 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  21.01 
 
 		 340 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  27.47 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  38.1 
 
 		 862 aa  44.3  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  41.67 
 
 		 872 aa  44.3  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4029  hypothetical protein  42.42 
 
 		 326 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  39.13 
 
 		 322 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  37.14 
 
 		 854 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  25.8 
 
 		 386 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  30.21 
 
 		 320 aa  43.5  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  29.17 
 
 		 847 aa  42.7  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>