14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7630 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7630  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  684    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2668  hypothetical protein  63.25 
 
 
356 aa  381  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0966636  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1430  hypothetical protein  40.65 
 
 
346 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12769  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1563  glycosyl transferase, group 1  35.42 
 
 
743 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2065  glycosyl transferase, group 1  35.58 
 
 
750 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07690  predicted integral membrane protein  33.65 
 
 
368 aa  106  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0518131  normal  0.346102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4553  glycosyl transferase, group 1  35.05 
 
 
356 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1442  hypothetical protein  36 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  24.51 
 
 
392 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  28.57 
 
 
345 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  23.75 
 
 
345 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09020  hypothetical protein  37.04 
 
 
317 aa  46.6  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.473565  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  33.57 
 
 
783 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32280  hypothetical protein  25.44 
 
 
341 aa  43.9  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.355174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>