15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07690 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_07690  predicted integral membrane protein  100 
 
 
368 aa  704    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0518131  normal  0.346102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1430  hypothetical protein  39.82 
 
 
346 aa  180  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12769  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2668  hypothetical protein  34.34 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0966636  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7630  hypothetical protein  33.65 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1563  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
743 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4553  glycosyl transferase, group 1  32.51 
 
 
356 aa  89.4  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2065  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
750 aa  87.8  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1442  hypothetical protein  29.33 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  24.23 
 
 
392 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2377  hypothetical protein  34.86 
 
 
362 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.436987  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4822  hypothetical protein  25.88 
 
 
393 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4203  hypothetical protein  35.82 
 
 
374 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32280  hypothetical protein  28.36 
 
 
341 aa  43.9  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0194  hypothetical protein  24.14 
 
 
392 aa  43.5  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327389  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  30 
 
 
339 aa  43.5  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>