26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0194 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0194  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  767    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327389  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0458  hypothetical protein  84.53 
 
 
367 aa  534  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.744609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0168  hypothetical protein  76.36 
 
 
378 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0177  hypothetical protein  76.36 
 
 
378 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0158  hypothetical protein  76.63 
 
 
378 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0251545 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10206  transmembrane protein  67.83 
 
 
427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.652566 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  53.69 
 
 
392 aa  360  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  45.41 
 
 
396 aa  269  5.9999999999999995e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  37.29 
 
 
793 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  36.21 
 
 
773 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  31.62 
 
 
843 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  33.9 
 
 
801 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  27.4 
 
 
792 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  31.71 
 
 
783 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6876  hypothetical protein  30.06 
 
 
344 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0580  hypothetical protein  27.4 
 
 
329 aa  47.4  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  30.93 
 
 
851 aa  47.4  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  33.73 
 
 
859 aa  47.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  28 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  25 
 
 
392 aa  45.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  24.93 
 
 
345 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4203  hypothetical protein  31.87 
 
 
374 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  24.63 
 
 
345 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0771  hypothetical protein  27.78 
 
 
348 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  31.71 
 
 
281 aa  43.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  36.56 
 
 
809 aa  42.7  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>