More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2065 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1563  glycosyl transferase, group 1  65.64 
 
 		 743 aa  863    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2065  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 750 aa  1434    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  44.2 
 
 		 367 aa  228  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1433  glycosyl transferase group 1  42.33 
 
 		 375 aa  228  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.259311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7628  Glycosyltransferase-like protein  43.13 
 
 		 372 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294474  normal  0.180766 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2548  glycosyl transferase group 1  43.21 
 
 		 380 aa  195  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.339834  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1430  hypothetical protein  37.65 
 
 		 346 aa  162  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7630  hypothetical protein  36.06 
 
 		 353 aa  158  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3037  glycosyl transferase group 1  36.77 
 
 		 386 aa  157  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.479562  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2668  hypothetical protein  34.65 
 
 		 356 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0966636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4553  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 		 356 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  27.73 
 
 		 376 aa  112  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 		 387 aa  107  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_006686  CND02330  transferase, putative  28.89 
 
 		 783 aa  102  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.795386  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  31.21 
 
 		 383 aa  97.8  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  23.76 
 
 		 389 aa  96.3  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 360 aa  95.5  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 		 374 aa  95.1  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 		 378 aa  94.7  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00636  hypothetical protein similar to phosphatidylinositol:UDP-GlcNAc transferase PIG-A (Broad)  26.2 
 
 		 488 aa  93.6  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0909226  normal  0.40959 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  29.13 
 
 		 377 aa  92.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 		 371 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07690  predicted integral membrane protein  29.56 
 
 		 368 aa  92.8  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0518131  normal  0.346102 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 360 aa  92.4  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 		 406 aa  90.1  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2479  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 380 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0145757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 406 aa  90.1  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 		 378 aa  89  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 365 aa  89  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 		 381 aa  89.4  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1323  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.88 
 
 		 405 aa  88.6  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271597  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.62 
 
 		 385 aa  87  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 		 376 aa  87  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.97 
 
 		 379 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.02 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  34.53 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4075  glycosyl transferase, group 1  32.87 
 
 		 744 aa  84.7  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  24 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  29.8 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  36.48 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3484  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.08 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3033  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.6 
 
 		 382 aa  83.6  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 355 aa  83.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  28.14 
 
 		 382 aa  84  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 		 394 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  23.36 
 
 		 390 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 		 409 aa  83.2  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 372 aa  83.2  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 536 aa  82  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  37.28 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  20.9 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.95 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 		 415 aa  80.1  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 381 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 405 aa  80.1  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  27.55 
 
 		 379 aa  80.5  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 367 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 		 381 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2134  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 		 370 aa  79.7  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.68 
 
 		 404 aa  80.1  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 		 373 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0496  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  20.97 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50490  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol (GPI) biosynthetic protein  24.94 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0309311  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3504  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.63 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  27.3 
 
 		 430 aa  77.4  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  18.75 
 
 		 355 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54068  n-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  24.42 
 
 		 450 aa  77  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.15052  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  23.3 
 
 		 393 aa  77  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 		 377 aa  77  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0690  glycosyl transferase group 1  35.4 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.945195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  24.44 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 		 376 aa  76.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 		 376 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3310  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 		 368 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 		 370 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>