33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4032 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  100 
 
 		 916 aa  1752    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  44.7 
 
 		 872 aa  620  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  52.55 
 
 		 859 aa  531  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  50.09 
 
 		 862 aa  499  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  50.51 
 
 		 873 aa  438  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  39.12 
 
 		 801 aa  320  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  40.51 
 
 		 793 aa  317  6e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  41.77 
 
 		 843 aa  310  8e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  35.21 
 
 		 854 aa  281  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  35.79 
 
 		 792 aa  277  6e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  38.76 
 
 		 809 aa  261  6e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  32.01 
 
 		 853 aa  239  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  36.4 
 
 		 783 aa  231  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  33.94 
 
 		 773 aa  223  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  27.29 
 
 		 811 aa  221  3.9999999999999997e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  30.19 
 
 		 795 aa  174  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  29.6 
 
 		 803 aa  174  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  28.73 
 
 		 795 aa  153  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  34.16 
 
 		 313 aa  138  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0898  hypothetical protein  28.94 
 
 		 787 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272517  hitchhiker  0.00789103 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0909  hypothetical protein  28.94 
 
 		 787 aa  119  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0892  hypothetical protein  28.94 
 
 		 787 aa  119  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0229028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2924  hypothetical protein  34.56 
 
 		 293 aa  107  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  29.75 
 
 		 442 aa  90.1  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  28.98 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  26.64 
 
 		 447 aa  72  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  33.64 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  31.82 
 
 		 345 aa  55.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0170  hypothetical protein  29.43 
 
 		 318 aa  53.5  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  45.1 
 
 		 341 aa  45.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  23.81 
 
 		 392 aa  44.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  22.69 
 
 		 347 aa  44.7  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  35.14 
 
 		 851 aa  44.7  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>