53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0909 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0892  hypothetical protein  100 
 
 
787 aa  1536    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0229028  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  71.57 
 
 
795 aa  1012    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0909  hypothetical protein  100 
 
 
787 aa  1536    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  73.33 
 
 
795 aa  1087    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  71.23 
 
 
803 aa  1074    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0898  hypothetical protein  99.62 
 
 
787 aa  1532    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272517  hitchhiker  0.00789103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  32.27 
 
 
793 aa  211  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  30.16 
 
 
801 aa  209  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  27.87 
 
 
859 aa  192  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  31.93 
 
 
773 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  32.01 
 
 
843 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  26.31 
 
 
853 aa  171  5e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  32.09 
 
 
854 aa  169  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  34.77 
 
 
809 aa  167  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  32.6 
 
 
792 aa  159  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  28.53 
 
 
862 aa  146  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  25.45 
 
 
811 aa  145  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  33.56 
 
 
783 aa  146  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  29.21 
 
 
872 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  29.78 
 
 
873 aa  135  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  36.96 
 
 
916 aa  130  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  31.79 
 
 
313 aa  110  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  32.46 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  31.9 
 
 
447 aa  81.3  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2924  hypothetical protein  32.58 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0170  hypothetical protein  29.41 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  29.54 
 
 
329 aa  65.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  24.04 
 
 
360 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  25 
 
 
350 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1980  hypothetical protein  34.27 
 
 
341 aa  53.5  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335213  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  22.44 
 
 
342 aa  52.4  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  41.74 
 
 
342 aa  52.4  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  28.57 
 
 
346 aa  52.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  30.33 
 
 
247 aa  52  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  30.6 
 
 
346 aa  51.2  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  27.21 
 
 
862 aa  50.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0771  hypothetical protein  30.17 
 
 
348 aa  50.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  36.45 
 
 
1195 aa  49.3  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  26.99 
 
 
315 aa  49.3  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  25 
 
 
347 aa  48.9  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  25.52 
 
 
328 aa  47.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  22.38 
 
 
321 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  33.33 
 
 
339 aa  45.4  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0580  hypothetical protein  41.82 
 
 
329 aa  45.4  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  26.05 
 
 
861 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  26.05 
 
 
861 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  29.63 
 
 
861 aa  45.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  28.4 
 
 
861 aa  44.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  28.4 
 
 
861 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  24.69 
 
 
340 aa  44.7  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  28.4 
 
 
861 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  28.4 
 
 
861 aa  44.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  28.4 
 
 
861 aa  44.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>