47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1560 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  100 
 
 		 792 aa  1511    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  47.95 
 
 		 809 aa  532  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  38.88 
 
 		 793 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  38.14 
 
 		 801 aa  405  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  40.17 
 
 		 843 aa  365  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  34.53 
 
 		 854 aa  317  7e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  35 
 
 		 862 aa  285  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  34.7 
 
 		 859 aa  254  5.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  36.12 
 
 		 916 aa  249  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  33.08 
 
 		 872 aa  245  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  34.34 
 
 		 773 aa  241  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  34.37 
 
 		 873 aa  220  7e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  30.7 
 
 		 803 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  24.82 
 
 		 811 aa  169  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  30.72 
 
 		 795 aa  164  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  25.32 
 
 		 853 aa  161  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  29.57 
 
 		 795 aa  158  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0909  hypothetical protein  30.86 
 
 		 787 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0892  hypothetical protein  30.86 
 
 		 787 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0229028  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0898  hypothetical protein  30.86 
 
 		 787 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272517  hitchhiker  0.00789103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  36.64 
 
 		 442 aa  111  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  31.52 
 
 		 313 aa  98.6  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  34.92 
 
 		 447 aa  87  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  30.21 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0170  hypothetical protein  31.97 
 
 		 318 aa  76.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2924  hypothetical protein  42.71 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  30.27 
 
 		 392 aa  63.9  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0458  hypothetical protein  30.27 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.744609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  35.06 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0158  hypothetical protein  27.34 
 
 		 378 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0251545 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0177  hypothetical protein  27.34 
 
 		 378 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0168  hypothetical protein  27.34 
 
 		 378 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  41.67 
 
 		 342 aa  54.3  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0194  hypothetical protein  31.17 
 
 		 392 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  48.57 
 
 		 1195 aa  53.5  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  44.74 
 
 		 339 aa  51.2  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  30.66 
 
 		 339 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  26.02 
 
 		 351 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2627  hypothetical protein  34.95 
 
 		 355 aa  49.3  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0802533  normal  0.461146 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10206  transmembrane protein  31.85 
 
 		 427 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.652566 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1980  hypothetical protein  31.82 
 
 		 341 aa  47.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335213  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6876  hypothetical protein  33.33 
 
 		 344 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2298  hypothetical protein  43.55 
 
 		 344 aa  46.6  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  43.28 
 
 		 337 aa  46.2  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  37.8 
 
 		 346 aa  46.6  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0580  hypothetical protein  41.07 
 
 		 329 aa  45.4  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  23.97 
 
 		 315 aa  44.3  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>