41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1230 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  635    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  65.19 
 
 
339 aa  427  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1980  hypothetical protein  43.66 
 
 
341 aa  228  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335213  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  41.49 
 
 
342 aa  203  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  31.25 
 
 
341 aa  129  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1101  hypothetical protein  33.53 
 
 
347 aa  124  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0490804  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2298  hypothetical protein  28.34 
 
 
344 aa  94.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  27.04 
 
 
330 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  20.62 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  25.63 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  26.89 
 
 
330 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  24.65 
 
 
318 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  26.89 
 
 
330 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  32.81 
 
 
853 aa  53.1  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  20.4 
 
 
340 aa  52  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3872  membrane protein  27.46 
 
 
329 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10202  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  23.4 
 
 
352 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  34.26 
 
 
339 aa  51.2  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  24.3 
 
 
318 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4298  hypothetical protein  27.24 
 
 
339 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09392  normal  0.365845 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  22.66 
 
 
340 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0626  hypothetical protein  26.15 
 
 
339 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0246806 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  23.1 
 
 
385 aa  50.1  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  28.11 
 
 
332 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  22.26 
 
 
340 aa  49.3  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  36.15 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  40 
 
 
792 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  23.73 
 
 
340 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  29.56 
 
 
392 aa  47.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  46.15 
 
 
872 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  48.08 
 
 
783 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  32.56 
 
 
862 aa  47.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  28.91 
 
 
859 aa  46.2  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  30.26 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  40 
 
 
793 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  24.88 
 
 
346 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  31.97 
 
 
396 aa  43.1  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3396  membrane protein  25.22 
 
 
333 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4123  hypothetical protein  25.22 
 
 
333 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  19.16 
 
 
316 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  25 
 
 
340 aa  42.7  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>