37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2505 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  100 
 
 
862 aa  1667    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  56.89 
 
 
872 aa  827    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  50.06 
 
 
859 aa  738    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  48.41 
 
 
873 aa  632  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  49.91 
 
 
916 aa  469  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  32.1 
 
 
801 aa  328  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  34.52 
 
 
843 aa  311  4e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  34.69 
 
 
793 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  30.43 
 
 
853 aa  299  1e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  30.6 
 
 
854 aa  284  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  35.71 
 
 
792 aa  279  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  26.2 
 
 
811 aa  274  5.000000000000001e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  37.33 
 
 
809 aa  262  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  29.54 
 
 
773 aa  218  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  29.29 
 
 
803 aa  213  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  34.11 
 
 
783 aa  198  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  27.75 
 
 
795 aa  195  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  27.27 
 
 
795 aa  158  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0898  hypothetical protein  27.41 
 
 
787 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272517  hitchhiker  0.00789103 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0909  hypothetical protein  27.41 
 
 
787 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0892  hypothetical protein  27.41 
 
 
787 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0229028  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  33.09 
 
 
313 aa  110  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2924  hypothetical protein  31.14 
 
 
293 aa  86.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  33.62 
 
 
442 aa  87  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  29.82 
 
 
447 aa  77  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  29.41 
 
 
329 aa  76.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  40 
 
 
339 aa  53.5  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  40.51 
 
 
341 aa  52.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0170  hypothetical protein  27.14 
 
 
318 aa  51.2  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  55.77 
 
 
342 aa  49.3  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  30.15 
 
 
339 aa  47.8  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1980  hypothetical protein  39.62 
 
 
341 aa  45.8  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335213  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2588  integral membrane protein  31.8 
 
 
347 aa  45.8  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000735046  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  27.84 
 
 
1195 aa  46.2  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  40.3 
 
 
337 aa  45.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0580  hypothetical protein  38.18 
 
 
329 aa  44.7  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  22.68 
 
 
316 aa  44.7  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>