46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1977 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  100 
 
 
853 aa  1714    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  45.95 
 
 
811 aa  705    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  31.17 
 
 
859 aa  285  3.0000000000000004e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  30.03 
 
 
872 aa  280  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  30.13 
 
 
862 aa  274  4.0000000000000004e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  28.55 
 
 
801 aa  210  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  31.83 
 
 
916 aa  207  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  27.46 
 
 
873 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  29.84 
 
 
793 aa  201  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  27.87 
 
 
843 aa  198  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  27.24 
 
 
803 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  26.89 
 
 
795 aa  163  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  29.63 
 
 
792 aa  145  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  31.44 
 
 
783 aa  138  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  24.93 
 
 
795 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0898  hypothetical protein  26.44 
 
 
787 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272517  hitchhiker  0.00789103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0892  hypothetical protein  26.44 
 
 
787 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0229028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0909  hypothetical protein  26.44 
 
 
787 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  26.7 
 
 
809 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  27.66 
 
 
854 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  26.71 
 
 
773 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  29.44 
 
 
313 aa  79.3  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  28.57 
 
 
329 aa  58.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  27.68 
 
 
345 aa  57.8  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  28.09 
 
 
345 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  30.56 
 
 
339 aa  54.7  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  32.39 
 
 
339 aa  52  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  39.36 
 
 
339 aa  51.6  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2924  hypothetical protein  41.38 
 
 
293 aa  51.2  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  25.32 
 
 
442 aa  51.2  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  42.86 
 
 
342 aa  49.7  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  27.03 
 
 
351 aa  48.5  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  31.69 
 
 
1195 aa  47.8  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0580  hypothetical protein  43.64 
 
 
329 aa  47.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  41.43 
 
 
337 aa  47  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  24.49 
 
 
447 aa  46.6  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  54.35 
 
 
396 aa  46.2  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4203  hypothetical protein  43.28 
 
 
374 aa  45.8  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  30.13 
 
 
320 aa  45.8  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0667  hypothetical protein  34.81 
 
 
304 aa  46.2  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  0.807997 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05441  hypothetical protein  38.89 
 
 
318 aa  45.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180339  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  35.64 
 
 
327 aa  45.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0489  hypothetical protein  37.5 
 
 
318 aa  44.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.418577  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  22.44 
 
 
334 aa  44.7  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  28.12 
 
 
370 aa  44.3  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0465  hypothetical protein  22.68 
 
 
298 aa  44.3  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>