34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2924 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2924  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  542  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  42.22 
 
 
313 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  37 
 
 
859 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  34.81 
 
 
916 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  33.58 
 
 
793 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  34.01 
 
 
843 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  33.06 
 
 
801 aa  96.3  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  31.23 
 
 
803 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  35.16 
 
 
792 aa  93.6  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  31.2 
 
 
795 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  33.22 
 
 
783 aa  85.9  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  32.97 
 
 
773 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  29.96 
 
 
854 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  32.21 
 
 
862 aa  80.5  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  33.21 
 
 
809 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  35.48 
 
 
872 aa  79.7  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  32.25 
 
 
442 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  33.7 
 
 
873 aa  75.1  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  31.39 
 
 
447 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  25.57 
 
 
811 aa  67  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0898  hypothetical protein  32.58 
 
 
787 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272517  hitchhiker  0.00789103 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0909  hypothetical protein  32.58 
 
 
787 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0892  hypothetical protein  32.58 
 
 
787 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0229028  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  30.38 
 
 
795 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  29.5 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  26.84 
 
 
853 aa  57.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0170  hypothetical protein  26.83 
 
 
318 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  35.4 
 
 
345 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  44.59 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  22.03 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  29.73 
 
 
345 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1831  hypothetical protein  36.36 
 
 
362 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0771  hypothetical protein  27.89 
 
 
348 aa  42.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0580  hypothetical protein  40.74 
 
 
329 aa  42.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>