61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8950 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  69.48 
 
 		 801 aa  1008    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  56.84 
 
 		 843 aa  756    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  100 
 
 		 793 aa  1537    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  41.42 
 
 		 854 aa  479  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  37.23 
 
 		 773 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  40.46 
 
 		 792 aa  411  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  38.8 
 
 		 809 aa  389  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  35.32 
 
 		 859 aa  352  1e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  34.88 
 
 		 872 aa  339  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  34.83 
 
 		 862 aa  330  7e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  40.51 
 
 		 916 aa  290  6e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  34.11 
 
 		 873 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  36.31 
 
 		 783 aa  263  8.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  28.95 
 
 		 803 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  28.76 
 
 		 795 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  28.38 
 
 		 853 aa  216  9e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  31.56 
 
 		 795 aa  196  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  26.12 
 
 		 811 aa  196  2e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0898  hypothetical protein  30.31 
 
 		 787 aa  194  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272517  hitchhiker  0.00789103 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0909  hypothetical protein  30.31 
 
 		 787 aa  193  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0892  hypothetical protein  30.31 
 
 		 787 aa  193  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0229028  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  32.49 
 
 		 313 aa  113  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  31.58 
 
 		 442 aa  109  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  30.96 
 
 		 447 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  29.33 
 
 		 329 aa  95.1  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2924  hypothetical protein  33.58 
 
 		 293 aa  87.8  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0170  hypothetical protein  27.05 
 
 		 318 aa  73.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  25.08 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0194  hypothetical protein  37.29 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  36.84 
 
 		 396 aa  62  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  29.14 
 
 		 1195 aa  61.6  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0158  hypothetical protein  30.46 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0251545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0168  hypothetical protein  30.46 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0458  hypothetical protein  31.03 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.744609 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0177  hypothetical protein  30.46 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  41.67 
 
 		 339 aa  50.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  35.8 
 
 		 346 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  25.97 
 
 		 392 aa  49.7  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  36.14 
 
 		 247 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10206  transmembrane protein  35.78 
 
 		 427 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.652566 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  25.21 
 
 		 321 aa  48.1  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  27.19 
 
 		 315 aa  47.8  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  25.57 
 
 		 320 aa  47.8  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2627  hypothetical protein  41.51 
 
 		 355 aa  47.8  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0802533  normal  0.461146 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  34.67 
 
 		 847 aa  47.8  0.0009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  32.43 
 
 		 345 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  30.89 
 
 		 341 aa  47  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  32.43 
 
 		 345 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  23 
 
 		 321 aa  46.6  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  39.39 
 
 		 351 aa  45.8  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  33.08 
 
 		 342 aa  45.4  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  34.52 
 
 		 861 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2377  hypothetical protein  37.97 
 
 		 362 aa  45.4  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.436987  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4203  hypothetical protein  43.08 
 
 		 374 aa  45.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  35.71 
 
 		 862 aa  45.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3828  hypothetical protein  34.21 
 
 		 361 aa  45.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2298  hypothetical protein  27.15 
 
 		 344 aa  44.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  30.71 
 
 		 351 aa  44.3  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1703  hypothetical protein  34.18 
 
 		 335 aa  44.7  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  40 
 
 		 337 aa  44.3  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0886  hypothetical protein  36.92 
 
 		 344 aa  44.3  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>