28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2627 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2627  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  694    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0802533  normal  0.461146 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  24.46 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  26.4 
 
 		 247 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  37.35 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  37.37 
 
 		 801 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  27.98 
 
 		 342 aa  49.7  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  24.64 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  34.69 
 
 		 889 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  34.69 
 
 		 889 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  30 
 
 		 783 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  34.69 
 
 		 889 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  41.51 
 
 		 793 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  34.69 
 
 		 864 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  36.17 
 
 		 792 aa  46.6  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  32.65 
 
 		 864 aa  46.2  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  25.37 
 
 		 392 aa  46.2  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  29.53 
 
 		 392 aa  45.4  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  33.67 
 
 		 864 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  38.46 
 
 		 773 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1913  hypothetical protein  41.05 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  33.67 
 
 		 864 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  25.76 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0731  hypothetical protein  29.92 
 
 		 573 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  39.62 
 
 		 843 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4203  hypothetical protein  25.21 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  25.61 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  35.85 
 
 		 795 aa  43.5  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  25.74 
 
 		 340 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>