30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5628 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  100 
 
 
442 aa  824    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  60.27 
 
 
447 aa  333  5e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  31.23 
 
 
793 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  34.02 
 
 
792 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  33.1 
 
 
809 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  32.92 
 
 
773 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  30.03 
 
 
803 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  29.94 
 
 
795 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  31.64 
 
 
801 aa  95.5  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  30.08 
 
 
859 aa  93.2  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  30.67 
 
 
854 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  28.26 
 
 
916 aa  90.5  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  29.15 
 
 
783 aa  89.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  31.9 
 
 
329 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  33.73 
 
 
843 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  31.22 
 
 
795 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0170  hypothetical protein  32.51 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  31.16 
 
 
862 aa  73.9  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2924  hypothetical protein  31.39 
 
 
293 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  25.23 
 
 
392 aa  57.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2588  integral membrane protein  36.36 
 
 
347 aa  57.4  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000735046  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  28.72 
 
 
873 aa  54.3  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  23.59 
 
 
811 aa  52  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0909  hypothetical protein  31.06 
 
 
787 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0892  hypothetical protein  31.06 
 
 
787 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0229028  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  25.82 
 
 
853 aa  48.9  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0898  hypothetical protein  31.06 
 
 
787 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272517  hitchhiker  0.00789103 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  28.52 
 
 
313 aa  47  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  26.8 
 
 
872 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  38.04 
 
 
339 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>