33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0917 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  863    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  61.09 
 
 		 442 aa  339  5.9999999999999996e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  31.83 
 
 		 803 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  32.69 
 
 		 795 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  31.38 
 
 		 773 aa  96.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  30.6 
 
 		 793 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  34.54 
 
 		 792 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  27.34 
 
 		 859 aa  89.7  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  30.94 
 
 		 795 aa  89  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  30.71 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  31.2 
 
 		 801 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  32.75 
 
 		 809 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  26.64 
 
 		 916 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  26.62 
 
 		 854 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  43.82 
 
 		 843 aa  76.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  30.45 
 
 		 862 aa  70.1  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  34.51 
 
 		 873 aa  63.9  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  37.12 
 
 		 783 aa  63.2  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0170  hypothetical protein  30.5 
 
 		 318 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2924  hypothetical protein  31.39 
 
 		 293 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  30.41 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  31.7 
 
 		 872 aa  60.1  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0898  hypothetical protein  32.39 
 
 		 787 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272517  hitchhiker  0.00789103 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0909  hypothetical protein  32.39 
 
 		 787 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  22.41 
 
 		 811 aa  55.8  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0892  hypothetical protein  32.39 
 
 		 787 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0229028  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  25 
 
 		 853 aa  51.6  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  35.63 
 
 		 1195 aa  47.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  31.39 
 
 		 346 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  28.29 
 
 		 861 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  25.68 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  34.52 
 
 		 247 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2588  integral membrane protein  32.63 
 
 		 347 aa  43.1  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000735046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>