27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2588 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2588  integral membrane protein  100 
 
 
347 aa  639    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000735046  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  37.72 
 
 
442 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  32.06 
 
 
859 aa  76.3  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  28.73 
 
 
793 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  30.8 
 
 
792 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  31.88 
 
 
447 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  29.96 
 
 
801 aa  69.3  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  34.33 
 
 
795 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  33.91 
 
 
803 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  33.46 
 
 
773 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  29.23 
 
 
916 aa  67  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  39.71 
 
 
783 aa  66.6  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  32.64 
 
 
809 aa  66.2  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  31.76 
 
 
862 aa  65.9  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  36.51 
 
 
843 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  29.53 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  25.57 
 
 
811 aa  53.9  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  27.72 
 
 
854 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  34.26 
 
 
853 aa  52.8  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  29.15 
 
 
313 aa  52.8  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  31.25 
 
 
872 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  48.44 
 
 
339 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  46.88 
 
 
337 aa  47.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  40.78 
 
 
342 aa  47  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  26.77 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  30.77 
 
 
795 aa  43.9  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  43.1 
 
 
392 aa  42.7  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>