50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1732 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  544  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2886  integral membrane protein  62.28 
 
 		 322 aa  329  3e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.588133  normal  0.167776 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  26.41 
 
 		 340 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  26.13 
 
 		 340 aa  105  7e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  24.65 
 
 		 340 aa  105  9e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  26.06 
 
 		 340 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  27.05 
 
 		 338 aa  85.9  7e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  24.62 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  28.62 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  24.72 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  28.16 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  26.02 
 
 		 344 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  26.74 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2265  hypothetical protein  27.17 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  26.87 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  24.67 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  26.96 
 
 		 339 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  25.09 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  23.55 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  21.71 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  24.12 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  24.42 
 
 		 320 aa  50.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0692  hypothetical protein  25.22 
 
 		 326 aa  49.3  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101924  normal  0.0824925 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  26.58 
 
 		 859 aa  48.9  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  22.32 
 
 		 586 aa  48.9  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  24.91 
 
 		 322 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  22.59 
 
 		 346 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  22.92 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  20.6 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  20.97 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  28.44 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  23.51 
 
 		 347 aa  47.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10206  transmembrane protein  33.68 
 
 		 427 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.652566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0194  hypothetical protein  36.56 
 
 		 392 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  23.95 
 
 		 337 aa  46.6  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0458  hypothetical protein  34.69 
 
 		 367 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.744609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  27.56 
 
 		 386 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  22.18 
 
 		 333 aa  45.8  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0158  hypothetical protein  31.58 
 
 		 378 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0251545 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  28.28 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1101  hypothetical protein  23.96 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0490804  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  23.97 
 
 		 341 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  25.94 
 
 		 342 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  26.72 
 
 		 323 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  21.98 
 
 		 319 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0168  hypothetical protein  30.53 
 
 		 378 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0177  hypothetical protein  30.53 
 
 		 378 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  27.43 
 
 		 344 aa  42.7  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  28.16 
 
 		 340 aa  42.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  26.38 
 
 		 315 aa  42.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>