34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1651 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1651  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  654    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0104013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  37.06 
 
 
332 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  37.13 
 
 
333 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  36.83 
 
 
333 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  37.04 
 
 
330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1222  hypothetical protein  40.31 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.997837  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  37.41 
 
 
330 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  36.36 
 
 
330 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  36.71 
 
 
330 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17930  hypothetical protein  41.06 
 
 
330 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558926  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  26.32 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  27.02 
 
 
340 aa  67  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  25 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  22.87 
 
 
347 aa  65.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  25 
 
 
345 aa  59.3  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  20.27 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  22.85 
 
 
351 aa  57.4  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  23.86 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  23.42 
 
 
352 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  22.3 
 
 
348 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  22.14 
 
 
352 aa  53.1  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  22.95 
 
 
346 aa  52.8  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  24.82 
 
 
358 aa  51.2  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  26.57 
 
 
352 aa  50.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1933  hypothetical protein  23.83 
 
 
360 aa  49.7  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.235318  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  23.96 
 
 
358 aa  49.7  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  22.01 
 
 
323 aa  49.3  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  24.47 
 
 
342 aa  48.5  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  22.64 
 
 
374 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  22.49 
 
 
333 aa  47.4  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  25.68 
 
 
337 aa  47  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  29.9 
 
 
342 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  25.67 
 
 
366 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  33.33 
 
 
341 aa  42.7  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>